Perustettiin 1878. Suomen itsenäistyttyä Lääkintöhallitus siirtyi 27.12.1918 sisäministeriön alaisuuteen; Sosiaali- ja terveysministeriön alaisuuteen se siirtyi vasta 1.7.1968. Lääkintöhallitus yhdistettiin 1. maaliskuuta 1991 Sosiaalihallituksen kanssa uudeksi Sosiaali- ja terveyshallitukseksi